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RNA 修饰海报

了解不同 RNA 修饰的化学结构及其在 mRNA 和 tRNA 中的分布和功能。 

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RNA 修饰 — 概述

表观遗传学领域正在形成许多全新的、令人兴奋的分支。其中之一便是 RNA 修饰研究领域。最近的 RNA 修饰检测和测序方法的开发进展(例如,miCLIP)表明,发现各种细胞类型或模式生物中新的修饰并将这些修饰定位至不同种类的 RNA 正变得更加容易和快速。这一技术的进展使得已知的 RNA 修饰的数量剧增。目前,已有 100 多种已知的 RNA 化学修饰,包括 m6Am1A m2,2G1。您可以在 mRNA、tRNA、rRNA 和 miRNA 等其他非编码 RNA 中发现这些 RNA 化学修饰。每一种修饰各有其功能,包括 RNA 结构、输出、稳定性和 mRNA 剪接。该研究领域的前景一片光明;关于部分这些新的、令人兴奋的修饰的功能,还有许多等待着我们去发现。 

mRNA 中的 RNA 修饰

您可以在 mRNA 中发现多种 RNA 修饰,有些甚至已经知道具有重要功能。mRNA 中存在的 RNA 修饰可能有几种不同的作用,包括改变 RNA 结构、促进 RNA-蛋白质结合以及改变 RNA 电荷或碱基配对潜能。m6A mRNA 中最常见的修饰之一,它具有促进 mRNA 剪接2、结构转换3、稳定性4和翻译效率5等多种功能。查找更多请查询我们的 m6A 通路和功能海报。 

tRNA 中的 RNA 修饰

在所有种类的 RNA 中,tRNA 包含最多的 RNA 修饰。tRNA 中几乎五分之一的核苷酸被认为含有 RNA 修饰6tRNA 上的修饰极其多样。一些修饰需要使用多种酶逐步形成7。您通常可以在 tRNA 的反密码子环中发现修饰。在此处发现的修饰通过促进密码子-反密码子相互作用以及阻止移码来提高翻译效率8


参考文献

Du, H., Zhao, Y., He, J., Zhang, Y., Xi, H., Liu, M., Ma, J., and Wu, L. (2016).
YTHDF2 destabilizes m6A-containing RNA through direct recruitment of the
CCR4–NOT deadenylase complex. Nat. Commun. 7, 12626.

1)Roundtree, I., Evans, M., Pan, T., & He, C. (2017) Dynamic RNA Modifications in Gene Expression Regulation. Cell, 1187-1200

2) Xiao, W., Adhikari, S., Dahal, U., Chen, Y.S., Hao, Y.J., Sun, B.F., Sun, H.Y., Li, A., Ping, X.L., Lai, W.Y., et al. (2016). Nuclear m6A Reader YTHDC1 Regulates mRNA Splicing. Mol. Cell 61, 507–519.

3) Liu, N., Dai, Q., Zheng, G., He, C., Parisien, M., and Pan, T. (2015). N6-methyladenosine-dependent RNA structural switches regulate RNA-protein interactions. Nature 518, 560–564.

4) Du, H., Zhao, Y., He, J., Zhang, Y., Xi, H., Liu, M., Ma, J., and Wu, L. (2016). YTHDF2 destabilizes m6A-containing RNA through direct recruitment of the CCR4–NOT deadenylase complex. Nat. Commun. 7, 12626.

5) Wang, X., Zhao, B.S., Roundtree, I.A., Lu, Z., Han, D., Ma, H., Weng, X., Chen, K., Shi, H., and He, C. (2015). N6-methyladenosine modulates messenger RNA translation efficiency. Cell 161, 1388–1399.

6) Kirchner, S., and Ignatova, Z. (2015). Emerging roles of tRNA in adaptive translation, signalling dynamics and disease. Nat. Rev. Genet. 16, 98–112.

7) Rubio, M.A.T., Gaston, K.W., McKenney, K.M., Fleming, I.M.C., Paris, Z., Limbach, P.A., and Alfonzo, J.D. (2017). Editing and methylation at a single site by functionally interdependent activities. Nature 542, 494–497.

8) Stuart, J.W., Koshlap, K.M., Guenther, R., and Agris, P.F. (2003). Naturally occurring modification restricts the anticodon domain conformational space of tRNA (Phe). J. Mol. Biol. 334, 901–918.





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